La segunda liguilla el sorteo emparejó al Valencia en el grupo B con el campeón de Europa, Manchester United, la Fiorentina y el Girondins de Burdeos. Finalizó la liguilla invicto (3 victorias y 3 empates) y líder en solitario con 12 puntos, superando así al Bayern que fue segundo con 9 puntos. En el año 2005 se produce un cambio de himno, este nuevo himno, conocido como «Almería Unión», nació oficialmente en junio de 2005. Este segundo himno fue creado por Guillermo Fernández tras una propuesta realizada por el presidente de la Peña «La Unión», Ángel García.
